| 6 | 0 | 15 |
| 下载次数 | 被引频次 | 阅读次数 |
本文旨在应用全基因组技术和选择信号分析方法揭示影响云上黑山羊产羔性状的关键遗传变异，挖掘多胎性状候选基因。选取繁殖率较高的云上黑山羊母羊59只，繁殖率较低的云岭山羊母羊27只，应用全基因组重测序技术进行变异检测，采用群体分化指数（Fst）和核苷酸多样性（θπ）方法联合进行选择信号分析，筛选多胎性状受到选择的候选区域，并进行基因注释、GO基因功能和KEGG通路富集分析，进一步筛选与山羊多胎性状相关的候选基因。测序结果显示，86个样本测序平均深度11.57×，与参考基因组的平均比对率为99.85%；联合Fst和 θπ 的分析结果进行选择性清除，共筛选到298个候选区域，注释到176个基因；GO功能和KEGG通路富集分析筛选出5个可能与山羊产羔性状相关的候选基因。本研究为实现山羊多胎性状的基因组选择提供了新的候选基因和分子标记，有助于加速云上黑山羊高繁品系的选育进程。
Abstract：[1] 金美林， 陆健， 费晓娟， 等. 全基因组选择信号揭示绒山羊绒毛性状相关的候选基因[J].畜牧兽医学报， 2020，51(12): 2991-3000.
[2] Zheng Z， Wang X， Li M， et al. 2020. The origin of domestication genes in goats[J]. Sci. Adv.， 2020， 6(21): eaaz5216.
[3] Liang D， Zhao P， Si J， Fang L， et al. Genomic analysis revealed a convergent evolution of LINE-1 in coat color: A case study in water buffaloes (Bubalus bubalis)[J]. MBE， 2021， 38(3):1122-1136.
[4] Yang B G， Yuan Y， Zhou D K， et al. Genome‐wide selection signal analysis of Australian Boer goat reveals artificial selection imprinting on candidate genes related to muscle development[J]. Anim Genet， 2021， 52(4): 550-555.
[5] Rajawat D， Panigrahi M， Kumar H， et al. Revealing genomic footprints of selection for fiber and production traits in three Indian sheep breeds[J]. J Nat Fibers， 2022， 19(16): 14963-14974.
[6] Peng W F， Zhang Y Y， Gao L， et al. Investigation of selection signatures of dairy goats using whole-genome sequencing data[J]. BMC Genomics， 2025， 26: 234.
[7] 梁家充， 江炎庭， 李卓然， 等. 云上黑山羊繁殖性能研究[J]. 云南畜牧兽医， 2018(4): 4-10.
[8] 《国家畜禽遗传资源委员会》编写组. 中国畜禽遗传资源志·羊志[M]. 北京: 中国农业出版社， 2011: 49，62，283.
[9] 《云南省畜禽遗传资源委员会》编写组. 云南省畜禽遗传资源志[M]. 云南: 云南省出版集团公司， 2015:221.
[10] Duan J， Xu P， Zhang H， et al. Mechanism of hormone and allosteric agonist mediated activation of follicle stimulating hormone receptor[J]. Nat Commun， 2023， 14(1):519.
[11] Shinde G， Ingawale M， Kuralkar S， et al. Follicle stimulating hormone receptor gene polymorphism and its association with fecundity in goats [J]. Indian Inst Sci， 2019， 89 (7):798-800.
[12] 周步峰， 石福岳， 张建军， 等. FSHR 基因多态性及其与陇东绒山羊产双羔关联性分析[J]. 中国畜牧杂志， 2021， 57(8):67-71.
[13] 马开宇. 基于外源激素处理的楚宝黑头羊生殖激素变化规律及产羔性状分子标记筛选[D]. 武汉: 华中农业大学， 2024.
[14] 寸静宇， 刘秋月， 王翔宇， 等.小尾寒羊LHR基因组织表达、多态性及其与产羔性状的关联分析[J]. 畜牧兽医学报， 2019， 50(3): 495-506.
[15] 王翔宇， 田志龙， 潘林香， 等. 鲁中肉羊LHCGR 基因突变与其产羔数关联分析[J]. 家畜生态学报， 2020， 41(10):13-17.
[16] 荣轩， 孟科， 邵顺成， 等. 5个绵羊群体 LHCGR 基因多态性及其与产羔数的关联分析[J]. 农业生物技术学报， 2022， 30(12): 2344-2353.
[17] Zhao Z， Zou X， Lu T， et al. Identification of mRNAs and lncRNAs Involved in the Regulation of Follicle Development in Goat[J]. Front Genet， 2020， 11: 589076.
[18] Wang S， Amidi F， Beall M， Gui L， et al. Aquaporin 3 expression in human fetal membranes and its up-regulation by cyclic adenosine monophosphate in amnion epithelial cell culture[J]. J Soc Gynecol Investig. 2006， 13(3):181-185.
[19] 马小燕， 沈奇， 华莹， 等. MAPK 信号通路在复方丹参注射液调节人羊膜[J]. 中国中西医结合杂志， 2013， 33(6): 778-782.
[20] 吴小雅， 陈宇清. 胎儿生长受限影响因素及妊娠结局分析[J]. 妇幼健康， 202， 11(21): 138-141.
[21] 张春艳. 山羊繁殖性状的影响因素和遗传规律及分子调控机制研究[D]. 武汉: 华中农业大学， 2011.
[22] Yue M， Jiang J， Gao P， et al. Oncogenic MYC Activates a Feedforward Regulatory Loop Promoting Essential Amino Acid Metabolism and Tumorigenesis[J]. Cell Rep， 2017， 21(13):3819-3832.
[23] Knaus L S， Basilico B， Malzl D， et al. Large neutral amino acid levels tune perinatal neuronal excitability and survival[J]. Cell， 2023， 186(9): 1950-1967.
[24] Bian P P， Li J X， Zhou S S， et al. A Graph-based Goat Pangenome Reveals Structural Variations Involved in Domestication and Adaptation[J]. Mol Biol Evol， 2024， 41(12): msae251.
[25] Grive K J， Gustafson E A， Seymour K A， et al. TAF4b Regulates Oocyte-Specific Genes Essential for Meiosis[J]. PLoS Genet， 2016， 12(6): e1006128.
基本信息:
DOI：10.19556/j.0258-7033.20251009-01
中图分类号:S827.2
引用信息:
[1]朱兰,欧阳依娜,江炎庭,等.云上黑山羊产羔性状全基因组选择信号分析[J].中国畜牧杂志().DOI:10.19556/j.0258-7033.20251009-01.
基金信息:
国家自然科学基金项目（31960654）; 云南省兴滇英才支持计划（YFGRC202426）; 云南省基础研究专项（202401AT070267）; 云南省技术创新人才培养对象项目（202405AD350042）
2026-09-21
2026-09-21
2026-09-21